在使用查重软件时，首先要注意选择权威可靠的软件，避免使用免费的低质量工具。其次，要了解软件的使用方法，熟悉各项功能设置，保证查重过程准确无误。另外，定期更新软件版本，及时修复bug，提高查重效率。此外，注意保护个人隐私信息，不泄露敏感数据给第三方。

除了注意软件选择和功能设置外，使用查重软件时还要注意文档格式的兼容性，避免出现格式错乱导致查重结果不准确的情况。另外，建议在查重前对文档进行适当的排版和格式化，确保查重结果的准确性。同时，要注意遵守软件的用户协议，不得将软件用于非法用途，以免触犯相关法律法规。