论文查重软件的使用流程包括上传论文、选择查重设置、等待系统检测、查看报告等步骤。首先，打开论文查重软件，登录账号后选择上传论文，可一次上传多篇。接着，根据需求选择查重设置，如排除参考文献、调整查重比例等。然后，等待系统检测完成，这个过程通常很快。最后，查看查重报告，系统会给出查重结果，指出相似度高的部分并提供相似文献链接，帮助作者修改论文，确保原创性。

在使用论文查重软件时，还需注意几点：首先，要保证上传的论文格式正确，避免因格式问题导致检测失败。其次，要了解所使用的查重软件的特点和功能，选择适合自己需求的设置。此外，在查重过程中要注意保护个人隐私信息，避免信息泄露。最后，查重报告出来后，作者要认真分析报告内容，对于高相似度部分进行修改和引用规范化，确保论文原创性和学术道德。